云南沐姓改姓穆的原因主要有以下几点：

同音字替换：

由于“沐”和“穆”同音，沐家为了隐蔽身份，避免被清朝追杀，选择了较为常见的同音姓氏“穆”进行替换。

历史背景：

沐家是明朝时的沐王府后人，世代镇守云南，明亡后，又侍奉南明政权，还跟随过永历帝。在逃亡过程中，为了不暴露自己的真实身份，沐家选择了改姓。

反清复明：

沐家在历史上与明朝有深厚的渊源，改姓穆也可能是为了表达对明朝的忠诚，以及反清复明的秘密活动。

综上所述，云南沐姓改姓穆主要是出于隐蔽身份、避免追杀以及历史和文化背景的原因。