男孩给女孩备注“初一”可能有以下几种含义：

女生在上初一：

这是最直接的理解，可能男孩知道女孩正在上初一，因此用“初一”来备注她，以便于区分和记忆。

时间的先后顺序：

在中文里，“初”有时也可以表示时间上的先后顺序，比如“月初”表示一个月的开始，“年初”表示一年的开始。因此，“初一”可能是指某个特定时间点的前置词，比如男孩和女孩在某个活动或事件发生在初一之前或之初。

开始的阶段：

此外，“初”还可以表示某件事情的起始阶段，比如“初学者”表示刚开始学习的人，“初恋”表示第一次恋爱。在这种情况下，“初一”可能是指女孩在某个领域或经历上的起始阶段。

综上所述，男孩给女孩备注“初一”最有可能是因为她正在上初一，以便于区分和记忆。当然，也有可能是基于时间顺序或起始阶段的考虑。具体含义需要结合实际情况来判断。