阮翠云和万剑锋的结局是 阮翠云成为万夫人，照顾瘫痪的万剑锋，在商州定居，并找到了他们的儿子。尽管他们基于种种考虑没有相认，但他们最终幸福地生活在一起。

具体来说，阮翠云和万剑锋在经历了种种波折后，终于出宫并找到了他们的儿子。他们的儿子已经成家立室，并且生活美满。阮翠云和万剑锋选择在商州定居，过上了平静的生活。

此外，阮翠云在宫中的经历也充满了波折。她原本是司珍房的学婢，后来与侍卫万剑锋有情，珠胎暗结，但因为意外无法出宫。她只好将刚刚出生的孩子偷偷放入河中，让孩子被布公公发现并抚养。布公公的善良和讨喜让他收获了一份美好的爱情，而阮翠云和万剑锋的孩子也被他收养并抚养成人。

这些情节展现了阮翠云和万剑锋之间深厚的感情和命运的无常，最终他们还是找到了幸福的生活。