《菩提树下》的大结局是完满的。关厚朴（由钟汉良饰演）和周镜心（由杨蕊饰演）以及他们的孩子历经苦难，最终终于在一起。在剧情中，关厚朴原本平静的生活因为龙家兄妹的介入变得支离破碎，但他始终对周镜心坚持，并遇到对自己慢慢倾心的农普洱。虽然过程中经历了种种波折和痛苦，包括被自己的亲妹妹莲生痴缠和陷害，但最终关厚朴选择放下仇恨，与镜心和孩子们共同走向了幸福的生活。

具体来说，在大结局中，舞笙（由李子雄饰演）为了成全关厚朴和周镜心，选择悄悄离开。他大难不死，而周镜心在得知这一消息后喜极而泣，这一幕被关厚朴看在眼里。舞笙还为关厚朴治疗了眼睛，然后离开，让关厚朴和周镜心以及他们的孩子还原了一个完整的家。此外，龙家人也意识到了自己的错误，并为自己的行为付出了代价，最终关厚朴和周镜心以及他们的孩子幸福地生活在一起。