司马懿家族最终是被 刘裕所灭。在晋朝末年，刘裕起兵推翻了司马家族建立的政权，建立了刘宋。刘裕在建立刘宋后，对司马家族成员进行了大规模的屠杀，导致司马家族几乎被灭族。这场屠杀被称为“永嘉之祸”后的一场战乱，持续了十多年，直到晋怀帝时期才结束，但那时晋朝已经走到了末路，西晋直接被少数民族所灭。刘裕的行动可以被视为一种因果报应，因为司马家族在历史上曾多次通过权谋和背叛来巩固自己的权力，最终却未能逃脱被灭族的命运。