吴孟超院士是一位杰出的医学家，他的一生都在为医学事业做出贡献。以下是他所获得的一些重要奖项和荣誉：

2005年度国家最高科学技术奖

2011年感动中国十大年度人物

军队干部保健终身贡献奖

军队医学科技重大成果特别贡献奖

国际肝胆胰协会杰出成就金奖

何梁何利医学基金奖

光华科技基金特等奖

全国高等医药教材特殊贡献奖

上海市医学荣誉奖

全军科技重大贡献奖

全国“侨界十杰”荣誉称号

“模范医学专家”荣誉称号

“全国优秀共产党员”荣誉称号

“感动中国”年度人物

“全国优秀科技图书奖”

“全国百名优秀医生”称号

“全国归侨侨眷先进个人”称号

“实用医学荣誉奖”

“爱国奉献奖”

“陈嘉庚医药科技奖”

“中国人民解放军专业技术重大贡献奖”

“国际肝胆胰协会杰出成就金奖”

“全国高等医药教材特殊贡献奖”

“何梁何利基金科学与技术进步奖”

“美国旧金山东华医院荣誉奖”

“陈家庚医药科学奖”

“国家科技进步一等奖”

“全国优秀科技图书奖”

“全军践行当代革命军人核心价值观十大新闻人物”

“新中国成立后国防和军队建设作出重大贡献、具有重大影响的百名先进模范人物”

31. “上海市教育功臣”

32. “全国归侨侨眷先进个人”称号

33. “实用医学荣誉奖”

34. “爱国奉献奖”

35. “陈嘉庚医药科技奖”

36. “中国人民解放军专业技术重大贡献奖”

37. “国际肝胆胰协会杰出成就金奖”

38. “全国高等医药教材特殊贡献奖”

39. “何梁何利基金科学与技术进步奖”

40. “美国旧金山东华医院荣誉奖”

41. “陈家庚医药科学奖”

42. “国家科技进步一等奖”

43. “全国优秀科技图书奖”

44. “全军践行当代革命军人核心价值观十大新闻人物”

45. “新中国成立后国防和军队建设作出重大贡献、具有重大影响的百名先进模范人物”

46. “上海市教育功臣”

47. “全国归侨侨眷先进个人”称号

48. “实用医学荣誉奖”

49. “爱国奉献奖”

50. “陈嘉庚医药科技奖”

51. “中国人民解放军专业技术重大贡献奖”

52. “国际肝胆胰协会杰出成就金奖”

53. “全国高等医药教材特殊贡献奖”

54. “何梁何利基金科学与技术进步奖”

55. “美国旧金山东华医院荣誉奖”