余秋雨先生的《千年一叹》主要表达了以下思想：

对历史文明的深刻反思：

余秋雨通过游历多个文明古国，如希腊、埃及、伊拉克、伊朗等，对人类古代文明的兴衰进行了深刻的反思。他感叹这些文明的辉煌与衰败，并对人类自身在其中的角色感到叹息。

对文明断裂的忧虑：

书中，余秋雨特别关注了文明的断裂和传承问题，指出战争和争斗是人类文明断裂的重要原因。他呼吁人们要珍视文明，尤其是自己的文明，避免重蹈覆辙。

对人类自身的审视：

余秋雨在书中不仅反思了历史文明，还对自己所处时代的社会现象进行了审视。他认为人类在历史上有很多“折腾人、摆布人、报复人”的行为，这些行为虽然被磨砺到了炉火纯青的地步，但并不应该被视为文明发展史的一部分。

对和平与发展的期望：

余秋雨在书中表达了对世界和平的期望。他认为，尽管历史上充满了战争和争斗，但真正的英雄是那些冒死呼吁和平的人。他希望人们能够从历史的悲剧中吸取教训，珍视和平，避免新的冲突和破坏。

对人类未来的思考：

余秋雨在书中提出了一个重要的问题：如何在保持文明延续和发展的同时，避免整体性的衰落。他通过对比不同文明古国的命运，引发读者对中华文明如何保持自身特色和延续的思考。

总的来说，《千年一叹》不仅是对历史文明的深刻反思，也是对现代社会的警示和期望。余秋雨通过这本书，希望读者能够更加珍视和传承文明，避免重蹈历史的覆辙，共同创造一个更加美好的未来。