靖难之役后，朱棣夺取大明江山，对建文帝的近臣 齐泰、黄子澄和方孝孺进行了清算：

方孝孺

下场：被诛十族，方本人被车裂。

原因：因坚决反抗朱棣篡位，拒绝为其起草即位诏书，最终被施以车裂之刑。

齐泰

下场：被诛杀，家人被杀或流放。

原因：作为建文帝削藩政策的主要推动者之一，朱棣入南京后将其抓获并处死，其家族也受到牵连。

黄子澄

下场：被肢解，家人被杀或充军发配。

原因：同样作为削藩政策的重要参与者，黄子澄被朱棣视为奸臣，最终遭受车裂之刑，家族成员也未能幸免。

综上所述，齐泰、黄子澄和方孝孺三人在靖难之役后均遭到了朱棣的严厉清算，下场悲惨。